Magia nie jest prawdziwa – każdy to wie. Jednak gdy jest wykonywana przez prawdziwego eksperta, magia posiada zdolność zadziwiania i zachwycania publiczności. Kaito Kuroba, syn światowej sławy magika scenicznego Touichi Kuroby, nie jest obcy temu faktowi. Dobrze obeznany w sztuce zwodzenia i wprowadzania w błąd, Kaito często zakłóca życie otaczających go osób efektownymi sztuczkami i psikusami. Ale kiedy Kaito przypadkowo natyka się na ukryte przejście w swoim domu, odkrywa tajemnicę, która mogła być przyczyną śmierci jego ojca osiem lat temu – gołębio-biały strój Kida, Złodzieja Widmo. Chcąc dowiedzieć się więcej o swoim ojcu, Kaito zakłada strój i szuka klejnotu Pandora, który podobno zapewnia nieśmiertelność. Jednak nie tylko on szuka klejnotu – organizacja odpowiedzialna za śmierć jego ojca również siedzi mu na ogonie!

Magic Kaito śledzi odrodzenie Kaitou Kida, złodzieja-widmo nocy. Korzystając ze swoich manekinów, przebrań i charakterystycznego pistoletu na karty, Kaito wyrusza, by ukraść najcenniejsze klejnoty na świecie, odkrywając po drodze prawdę o śmierci swojego ojca i słynnym klejnocie Pandora.